春秋時期，晉楚秦爭霸，天下大亂。晉國首都曲沃一草澤大夫程嬰醫術高明，皇室多次欲延聘入宮封為御醫，但程嬰性如閒雲野鶴不好功名，且認為百姓更需要他醫治，故程嬰仍每日在市井之中行醫救人。晉國相國趙盾之子趙朔因屢次戰勝敵國，受晉國君王的愛戴。趙朔與莊姬公主自幼為青梅竹馬，兩情相悅，無奈晉王宣布為莊姬公主比武招親！武功高強的趙朔雖然率先奪得繡球，不料御史大人屠岸賈居然中途攔截，究竟誰能得到莊姬公主的繡球呢？

程嬰跌落山崖，所幸被盈香救起，盈香見程嬰不只是幫貧困百姓義診，還為了保護醫治的藥材而身受重傷，對程嬰欽佩不已，遂決定偷拿自家的藥材給程嬰，不料被盈香父親撞見，盈香父親勃然大怒，將她逐出家門。程嬰眼見盈香為了自己有家歸不得，便開口收留，兩人朝夕相處，情孚意合…。趙朔歡喜迎娶莊姬，晉升駙馬且晉王賜其虎符掌管晉國兵權，引起屠岸賈的妒嫉，加上晉王硬將孟妍賜婚給屠岸賈，讓他更是對趙朔心生不滿，究竟屠岸賈暗中策劃著什麼不軌之計…？

一名男子身受重傷臥倒在程家門外，程嬰將他帶回家中治療，不料將這名男子外衣打開，驚訝發現他原來是楚國的軍士？！星月趕緊說要報官，卻被程嬰阻止，他認為人命關天最為重，仍堅持收留醫治，這會為他帶來什麼禍端嗎…？趙朔凱旋歸來、百姓歡呼來相迎，途中一對年歲已大的夫婦攔阻請託，說明因家中獨子隨軍隊征戰多時未歸，希望能與兒子見上一面，趙朔理解軍士想歸鄉的心情，於是下令准予回鄉探親，此舉令程嬰出言感到欽佩，趙朔一見眼前此人，就是他尋覓多時的程大夫…。

趙朔與莊姬兩人感情甚篤，但莊姬多年未懷有身孕，自覺對不起趙家要趙朔另外納妾，為不辜負莊姬，趙朔表明不願納妾。程嬰與盈香被帶至駙馬府，莊姬久聞程大夫醫術高明，便請教程嬰如何懷子一事，沒想到程嬰回答他有一帖師傳獨門秘方…！盈香路上被不明歹徒劫走？！慌亂不已的程嬰只能求助趙朔，一查原來是晉王喜好女色，屠岸賈阿諛奉承，強行擄走曲沃雙嬌之一的盈香獻給晉王！身陷險境的盈香該如何是好？趙朔來得及搶救嗎…？

莊姬與盈香分別傳來懷孕的喜訊，趙程兩家來往頻繁，趙朔更提出未來趙家的孩子要拜程嬰為義父，兩家親上加親…。莊姬見晉王身體不適，推薦程嬰來宮中診斷，程嬰見晉王脈象平穩，但體內竟有一絲寒毒之氣纏繞於胸？這個寒毒之氣是從何而來的？程嬰為晉王治療後，晉王馬上感到身心舒暢，大讚程嬰醫術高明並賜給他一張令牌，讓程嬰可以隨時進宮為他治療…。

秦國派使臣前來，提議秦晉兩國聯盟消滅楚國，趙朔義無反顧地自願領兵前往，並在屠岸賈的煽動下，在晉王面前立下軍令狀，誓言如若戰敗，願意自盡以謝天下？！但趙朔不知，他已一步步走入屠岸賈所設下的險惡圈套…？！程嬰前往屠府為孟妍看診，不料竟意外發現，屠岸賈扣留各地大旱須開倉放糧的緊急奏本，致使全國百姓哀鴻遍野！程嬰趕緊稟報趙相國，但晉王昏庸，聽不進趙相國的諫言，竟一味聽信屠岸賈的讒言！正當眾人束手無策之時，程嬰自願前往軍營向趙朔通風報信，程嬰能及時阻止悲劇發生嗎…？

趙朔苦民所苦，不惜抗命開放軍糧賑災民，此舉傳到晉王殿上，晉王大怒，賜權齊御劍，命他去監軍，下令趙朔倘若不攻打楚國，就以御劍取他首級！趙相國極力勸諫阻攔，無奈晉王心意已決，趙相國為明志，竟當場自刎…？！程嬰為解決趙朔缺糧的燃眉之急，提議可向楚國將軍石光借糧，趙朔等人皆認為此舉不妥，但程嬰自告奮勇前往楚營，究竟他此次前往能獲得楚軍借糧？或是羊入虎口？腹背受敵的趙朔又該如何應對？

程嬰成功說服楚國將軍石光借糧給晉國，趙朔欽佩石光義氣相挺，也承諾不聯合秦軍對打楚國，正當趙朔打算班師回朝時，權齊前來阻止，趙朔對於晉王下令殺他感到震驚！不料權齊所帶來的噩耗不只一件，當趙朔聽到父親自刎一事後，更是悲慟不已…！趙朔氣憤決定找屠岸賈為父報仇，但遭程嬰阻止，程嬰苦勸趙朔向晉王稽首請罪才是上策！趙朔只有忍痛接受建言，當他自縛囚車並來到殿上向晉王稽首請罪時，晉王會如何處置？眼看趙朔這個眼中釘就要拔除，屠岸賈又會如何出招？

趙朔為了公孫杆臼莽撞對屠岸賈行刺一事，特地至屠府登門謝罪，不料受到屠岸賈的煽動，竟決定解散趙府三千門客！趙朔如今已無兵權，又無三千門客的保護，趙家的未來究竟會如何…？晉王連日身體不適且夢見有不明黑衣客追殺的噩夢！屠岸賈為了替晉王分憂，提議晉王至屠府舒心解悶，就在晉王開心離席時，居然出現黑衣客大膽行刺！屠岸賈等人馬上制伏黑衣客，拷問後竟回是趙府的門客，晉王震怒，下旨趙朔因通敵弒君，應當罪誅九族…？！

莊姬被晉王召回宮中安胎，沒想到趙府馬上遭到屠岸賈派重兵包圍！眼見趙朔危在旦夕，程嬰冒險入宮通報莊姬，不料趙朔寡不敵眾，在莊姬與程嬰趕回趙府時，他已遭箭穿肺腑，留下最後一口氣交代程嬰照顧莊姬母子後，隨即氣絕身亡…！悲慟萬分的莊姬因過度激動而早產生下一男嬰，趙家雖有子嗣，但一出生即父已身亡，趙朔只留下遺言，生男就取名「趙武」。莊姬深知屠岸賈心狠手辣，絕對不會放過趙家獨子，因此忍痛要程嬰將趙武帶離趙府，但屠岸賈已派重兵包圍，程嬰要如何保住趙氏孤兒…？

屠岸賈為了找出趙家嬰兒，竟殘暴下令，全城近幾天出世的嬰兒，不管是男是女全部處死！他寧可錯殺也不錯放的狠毒行徑，讓許多嬰兒無辜受害！眼見百姓哀鴻遍野，程嬰與公孫杆臼震驚但卻無計可施…？！屠岸賈搜遍全城仍找不到趙家嬰兒，很快地就會搜查到程家，到時不只是趙家嬰兒被抓，就連程嬰的兒子程清也無法倖免！程嬰與公孫杆臼焦急萬分，就在兩人苦無對策之時，公孫杆臼提出一個辦法，但為救趙氏孤兒，程嬰必須犧牲自己的兒子？！一邊是忠臣趙朔的遺孤、一邊是唯一的親骨肉，程嬰該如何抉擇…？

莊姬聽聞程嬰為了保護自己的兒子，反而讓趙武慘遭屠岸賈殺害！震驚不已的莊姬氣憤難忍，程嬰遭受莊姬誤解甚深，她會對程嬰做出報復的舉動嗎？屠岸賈一直想拉攏程嬰為自己辦事，此次程嬰幫他找到趙氏孤兒，他趁機要程嬰一家至屠府長住，程嬰一開始婉拒，但屠岸賈竟強行將程嬰一家接至屠府！趙氏孤兒就居住在屠府中，程嬰要如何保護他不被屠岸賈發現呢…？

盈香自從失去兒子悲傷過度後，身體每下愈況，屠岸賈答應程嬰請求，替程武找了一位奶娘為盈香分擔照護的工作。屠岸賈日漸看重程嬰，野心勃勃的他，眼見晉王昏庸無能又重病纏身，竟然要程嬰進宮為晉王醫病，不過不是醫「生」，而是醫「死」？！程嬰該如何是好…？為了醫治盈香的病，程嬰特別上山採藥，正當他取得藥引時，突然出現二名蒙面黑衣人要索取他的性命！程嬰會有生命危險嗎？這些黑衣人究竟是誰？他們的目的為何？

盈香見翠娘將程武照護得宜，且個性溫順善良，看她守寡多年，盈香要翠娘考慮自已未來的打算，還問她對程嬰的印象如何？究竟盈香心中的盤算是什麼？程武日漸成長，相貌也和趙朔越來越相像，為了不讓屠岸賈起疑，程嬰會如何處置？看到屠岸賈對程武有如親子般對待，程嬰竟然提議讓屠岸賈收程武為義子！讓趙朔的獨子認賊為父，程嬰這步棋到底走得對？還是不對呢…？

數年後，程武已長成英俊少年，聰明好學，更是難得練武奇才，讓屠岸賈與鹿遠傾囊相授教導他習刀練劍。程武自小與屠岸賈的女兒月華一起成長，兩人青梅竹馬彼此也情投意合，屠岸賈有意將兩人湊成一對…。程嬰對於程武的茁壯感到欣慰，但另一方面又擔心要如何向他說出實情，眼見他與屠家父女感情日益深厚，程嬰該如何是好…？

程嬰好不容易找到機會要向莊姬稟報趙武仍活著的訊息，不料莊姬一見到程嬰氣憤難耐，不聽程嬰解釋，就要人先毒打他一頓！程嬰被打得遍體鱗傷，正當他要說出口時，鹿遠現身搶救，讓程嬰有苦難言…！程武見到父親程嬰被打的一身是傷，急著要找莊姬理論，卻被程嬰制止，要他別惹事生非！程武表面順從父親，但憤憤不平的他與月華還是忍不住偷偷跑至趙家陵園，想找到莊姬並問清楚為何她要如此殘暴地傷害手無縛雞之力的文人…！

程嬰帶著畫冊至趙家陵園見莊姬，她看完畫冊上的圖畫後恍然大悟，原來程嬰不惜捨親兒救趙氏孤兒，而她卻誤會程嬰十幾年，令莊姬羞愧萬分！程嬰忍辱偷生只為等待時機讓莊姬與兒子相認，但他要如何告知程武？程武能接受實情嗎？程武為了遵守與程嬰的約定，避免與月華時常見面，開始躲著月華，就連原本兩人已約好外出遊玩，程武只能假借練功拒絕月華。自小一起長大的兩人，一旦得知上一代的恩怨，他們該如何面對？兩人的關係與感情會因此生變嗎？

程武得知自己與屠家的深仇大恨後，對月華的態度轉為冷淡，讓不知情的月華一頭霧水且傷心難過，眼見月華哭得淚汪汪，程武又感到心軟不捨！陷入兩難的他究竟要如何處理…？晉王下旨三日後要程武與晉國大將軍魏絳比武，為此程嬰四處奔波謀劃對策，究竟程嬰的計劃是什麼？程武能為一門忠烈的趙家洗刷冤屈嗎？