第1話【恐怖的屍】，不死的怪物－卡巴內襲擊了顯金驛。住在顯金驛的少年－生駒與逃亡的人群跑向相反的方向。為了自身的過去和榮耀，他打算用私下開發的貫筒和卡巴內戰鬥。

第2話【漫漫長夜】，勉強活了下來的生駒，往顯金驛唯一剩下的駿城「甲鐵城」前進。另一方面，年幼的少女－無名出現在正與卡巴內對峙的菖蒲一行人面前。她以超強的戰鬥力，開闢了通往甲鐵城的逃亡路線。

第3話【獻上祈禱】，離開顯金驛的甲鐵城，往幕府的要地－金剛郭前進。可是甲鐵城裡的人很快就開始對立，企圖把身為卡巴內里的生駒等人趕出去。突然成為領導人的菖浦也無力管理駿城內的人……。

第4話【血流成河】，生駒和無名被民眾們關進最後一節車廂內。這同時意味著甲鐵城的戰力變弱了。就在這時，卡巴內突然襲擊了甲鐵城。透過戰鬥成長變強的卡巴內－「技取」也在敵人的大軍中……。

第5話【無法逃離的黑暗】，八代驛被卡巴內摧毀了，而甲鐵城收留了當地的倖存者。倖存者中的榎久是無名的舊識。他說開始適應甲鐵城生活的無名變弱了。聞言，焦急的無名選擇進行一場無謀的戰鬥，讓自己陷入了險境。

第6話【聚集的光芒】，甲鐵城面對巨大的卡巴內－「黑煙」，陷入進退兩難的困境。另一方面，生駒和無名掉進廢驛的地底下。四周都是卡巴內，而且無名被壓在瓦礫下面。即使在這種沒有援軍的絕望情況下，生駒還是沒有放棄希望。

第7話【向天祈禱】，離開顯金驛後，甲鐵城首次來到有人生活的驛－「倭文驛」。生駒一行人到街上添購物資，享受久違的和平時光。另一方面，菖蒲和倭文驛交涉，希望對方可以分一點糧食給甲鐵城，但對每個地方而言，糧食都是很貴重的物資……。

第8話【沉默的獵人】，無名仰慕的兄長大人，是狩獵卡巴內的特殊部隊－－狩方眾的總長「美馬」。雖然人人都歌頌美馬為英雄，但生駒卻無法信任美馬。因為美馬就是將無名變成卡巴內里的元凶。

第9話【滅亡之牙】，甲鐵城來到了金剛郭前的最後一個驛－「磐戶驛」。幕府非常警戒富有聲望的美馬，關閉了通往金剛郭的道路。但美馬要求和磐戶驛領主面談。最後，美馬和狩方眾終於展開了倒幕行動。

第10話【反攻的弱者】，甲鐵城被迫和克城連結在一起，逞生等人處於狩方眾的嚴格管理之下，並被抽血。在人們絕望時，生駒不願放棄希望，為了奪回自由和榮耀還有無名，他策劃了反攻作戰。

第11話【燃燒的生命】，美馬和身為現任將軍的父親－興匡相隔10年終於再會了。他私底下正打算將無名變成「鵺」。另一方面，生駒雖然勉強活了下來，卻失去了自信和活下去的勇氣，變得非常膽小。看到卡巴內也只能顫抖的生駒，究竟該怎麼辦呢…？

第12話【甲鐵城】，在美馬的計畫之下，無名變成「鵺」了。卡巴內不斷湧入，讓金剛郭陷入了毀滅狀態。就在這時，生駒抵達了金剛郭。再次改造自己身體的生駒，為了拯救無名，勇敢地踏入了滿是敵人的金剛郭。