第1話【新生】，死神路克搞丟了他的「死亡筆記本」，被人間界的一個高中生夜神月撿到。夜神月原本不相信這本死亡筆記本，但是看了使用說明後不禁想嘗試一下，於是照著說明，將對方的名字寫在死亡筆記本上，結果對方真的死了。夜神月十分驚愕，因為自己頓時成了殺人犯，承受著精神上的折磨。接著，死神路克出現在夜神月的房裡…

第2話【對決】，夜神月知道死亡筆記本的威力後，開始大量的使用死亡筆記本殺人，但是他殺的大多是作姦犯科的罪犯，而這些罪犯都突然死於心臟痲痹。由於人數太多，死因太過巧合，引起ICPO國際刑警組織的關注，甚至找來神祕的破案頂尖高手「Ｌ」來參與偵辦。於是夜神月和Ｌ透過電視現場轉播展開一場大對決，究竟誰勝誰負呢？

第3話【交易】，夜神月殺掉出現在電視裡的假Ｌ之後，Ｌ因此推論奇樂是和日本警方內部有所關連的人，於是請來美國FBI協助祕密調查。但不久，跟蹤夜神月的探員就被死神路克發現了。但因為夜神月不知道他的名字，無法對他下手。此時路克告訴夜神月，如果他肯用剩餘壽命的一半交換，路克就能給他死神之眼看到對方的姓名。夜神月會答應這個交易嗎？

第4話【跟蹤】，月為了知道跟蹤他的警察的身份，先用一些囚犯做實驗，了解死前行為能控制到什麼程度。在確認無誤之後，故意利用死亡筆記本安排了一場挾持公車的戲碼，而對方也真的照他所想的一樣，表露了自己的身份，沒想到跟蹤他的竟然是FBI的探員…

第5話【策略】，月在知道一名FBI探員雷‧潘伯的名字之後，便以此要脅雷‧潘伯。雷‧潘伯別無他法，只好照著月的指示寫出了來到日本的其他FBI探員的名字，但是雷‧潘伯不知道他用來寫下名字的紙張就是死亡筆記本，而雷‧潘伯也在寫完之後心臟麻痺死亡…

第6話【破綻】，FBI探員雷‧潘伯死亡之後，來日本的所有FBI探員也都同時死亡了。而月故意讓其他在日本的FBI探員都收到其他探員們的照片和名字，讓L無法知道月是和誰接觸過，但是雷‧潘伯的未婚妻卻知道雷‧潘伯在死前曾經和奇樂接觸過，並且打算告訴警方這件事…

第7話【陰天】，雖然在筆記本上寫下了那名女子的姓名，但她卻沒死。月發覺對方使用假名後，處心積慮的要問出她的真名。

第8話【視線】，月發覺自己的房間受到監視了。為了洗刷自己的嫌疑，他利用攝影機的死角制裁罪犯。

第9話【接觸】，Ｌ和月進入同一所大學就讀，並且對月表明自己的真實身分。如果現在殺了Ｌ，自己就會被懷疑，月會怎麼做呢？

第10話【疑惑】，懷疑月是奇樂的L，為了分析月的個性而邀他打一場網球賽。此時，櫻花電視台卻收到了署名為奇樂的人寄來的錄影帶…

第11話【闖入】，錄影帶中預告的罪犯及不認同奇樂的媒體工作者都死了。宇生田急忙趕去阻止電視台繼續播放，而夜神局長會！？

第12話【愛意】，L認為有第二位奇樂卻故意不告訴月，讓他觀看錄影帶以便試探他的反應。而此時，擁有死神之眼的第二奇樂海砂則是…

第13話【表白】，月為了跟第二奇樂接觸而到了青山。沒想到卻被擁有死神之眼的海砂認出來了。

第14話【朋友】，海砂表明身分後，月決定利用她來查出L的名字。而看完新寄來的錄影帶後，L推論奇樂和第二奇樂已經接觸了。

第15話【賭注】，L表示，如果自己在近期內死亡的話，月就是奇樂。而正當他回學校找月時，碰巧遇見了在附近出外景的海砂…

第16話【決擇】，夜神月被監禁的兩週裡，真的沒有再度發生奇樂殺人事件，於是Ｌ越來越肯夜神月就是奇樂。但是過了兩週之後，奇樂殺人事件再度爆發，而夜神月和彌海砂依然被囚禁著，這究竟是怎麼回事？

第17話【執行】，龍崎請夜神局長過來，請他開車帶夜神月和彌海砂出去，到杳無人煙的地方開槍殺死夜神月，到時候看彌海砂和夜神月會不會現出奇樂本尊的樣子…

第18話【同伴】，Ｌ無法證明夜神月就是奇樂之後，夜神月查出四葉集團似乎和奇樂有所牽扯，使得Ｌ再度精神大振，全力投入調查，但是此時卻傳來警方高層決定放棄搜捕奇樂一事，如果搜查本部的刑警想繼續追捕奇樂，就必須辭職。

第19話【松田】，龍崎等人查出四葉集團可能和奇樂掛勾後，對四葉集團積極展開調查，而松田急著立功，竟然一個人獨自潛入四葉集團，偷聽機密會議時被發現，雖然他自稱是彌海砂的經紀人，但是四葉集團的人依然想殺他滅口。這時松田按下腰帶上的緊急求救訊號，龍崎要如何出手救他呢？

第20話【姑息】，Ｌ和月對四葉集團展開進一步調查，於是他找來海砂幫忙，請她混進四葉集團調查。月擔心海砂的安危，因此相當反對，但海砂卻說，為了月死不足惜…

第21話【活躍】，為了查明四葉集團和奇樂的關係，海砂以拍攝廣告之名潛入四葉集團，結果在洗手間遇上死神雷姆。雷姆為了保護海砂，讓她觸摸死亡筆記本的紙張，當海砂看得見雷姆之後，雷姆將過去的事情告訴她，並且要她小心現在的奇樂…

第22話【誘導】，海砂錄到火口錄音後，Ｌ於是計畫和櫻花電視台聯手引火口上鉤，叫以前充當海砂經紀人的松田上節目爆料，說火口就是奇樂，並且通知四葉集團的奈南川，叫他節目播出時假裝很慌亂、通知火口看電視。Ｌ是否能順利逮捕火口，並且查出奇樂殺人的方式呢？

第23話【狂騷】，火口為了除掉松田，在走路無路之際決定用一半的壽命和雷姆交換死神之眼。有了死神之眼後，火口趕回總公司，想調錄影帶出來看松田的畫面，查出他的真正姓名，但是Ｌ技高一籌，早就吩咐溫蒂把有關松田的資料全部銷毀…

第24話【復活】，抓到火口後，夜神總一郎因為辦案關係摸了死亡筆記本，隨即慘叫一聲把大家嚇壞了，因為他看到了死神雷姆，以為他是妖怪，接著相澤和松田也摸了筆記本，反應都一樣，於是Ｌ很好奇也摸了筆記本…

第25話【沈默】，夜神月和彌海砂重獲自由後，夜神月依然待在搜查本部協助Ｌ調查奇樂事件，而彌海砂則自由在外行動。夜神月利用彌海砂的死神之眼，要她下手殺了Ｌ，並且利用死神雷姆愛戀彌海砂的弱點，逼得雷姆出手救彌海砂，這麼一來死神雷姆也會死亡。果真，到了最後，渡死了，Ｌ死了，死神雷姆也死了。

第26話【再生】，Ｌ死了，渡也死了。大夥兒將Ｌ密葬後，開始討論如何擒拿奇樂以及死亡筆記本的處理問題。結果眾人一致認為應該由夜神月來繼承Ｌ的位置，繼續進行偵辦，而死亡筆記本則交給夜神總一郎祕密藏起來。緊接著，夜神月開始創造他所謂的新世界，猛烈的用死亡筆記本殺死罪犯。

第27話【綁架】，Ｌ死了，夜神月取代Ｌ的位置，而且更肆無忌憚的殺人。另一方面，為了培養繼承Ｌ的孤兒院方，得知Ｌ死後，由尼亞繼承Ｌ的位置，成為第二代Ｌ，對外自稱Ｎ，開始調查Ｌ的死亡。Ｎ終於和夜神月正式交手了，究竟鹿死誰手呢？

第28話【焦躁】，尼亞以&ampquotN&ampquot為代號，與現任L的月用電話進行接觸，也得知了月必須以死亡筆記本贖回被綁架的粧裕。

第29話【父親】，月成功的利用了死亡筆記本的規則找出持有人，並寫下梅洛身旁該持有人的名字，以判斷他們的據點。

第30話【正義】，尼亞對月的懷疑日漸加深。但&ampquot奇樂就是正義&ampquot的風氣漸起，就連美國總統也宣佈不再逮捕奇樂。

第31話【轉移】，出目川所煽動的暴徒包圍了SPK總部。確定別無他法之後，尼亞決定從大樓上撒下大筆美金，讓成員趁亂之際逃離現場。

第32話【選擇】，魅上積極地利用死亡筆記本來鏟除惡徒，並選擇NHN的主播高田清美來擔任奇樂新的代言人。不過，高田她也正巧是…

第33話【嘲笑】，尼亞為了打倒奇樂而來到日本，並向月下了挑戰書。另一方面，月將高田找來談話，為了不被監聽，便以筆談方式要求高田協助

第34話【警覺】，尼亞等人在解讀了魅上的唇語過後，確定他身邊沒有死神。另一方面，相澤查到了月和高田筆談的證據，然而…

第35話【殺意】，為了解決一切，尼亞要求與月見面。月為了除掉尼亞，對高田下達了最後的指令。然而高田卻被梅洛綁架了…

第36話【1.28】，1月28日，月和尼亞終於見面了。尼亞取下了面具，名字卻被在門外偷窺的魅上寫進了死亡筆記本…

第37話【新世界】，魅上將所有人的名字寫入死亡筆記本已經過1分鐘了。尼亞確定大家都沒事後便檢查了筆記本，也知道了唯一沒被寫的人是誰。